Расположен в селе Никольское на острове Беринга, единственном населённом пункте архипелага
Побывать на Командорских островах, походить по селу Никольское, посмотреть на лежбища морских котиков мечтают многие. Прикоснуться к истории архипелага и алеутов тоже небезынтересно. Это легко сделать в музее. Он создавался старожилами в 60-е годы прошлого века как народный. Два первых отдела - природы и истории - были открыты 11 июня 1965 г. Через год в музее была собрана первая экспозиция, приуроченная к дате – 225-летию открытия Командорских островов. Можно было потрогать пушки Витуса Беринга с пакетбота "Св. Пётр", увидеть удивительных морских зверей и птиц, познакомиться с культурой и жизнью островного народа.
Небольшое деревянное здание, в котором размещался сначала музей, из-за ветхости не сохранилось до наших дней. В 1976 г. музей был переведен в бывшее Уездное Управление, построенный по американскому проекту в конце XIX века. Непосредственное участие в строительстве принимал управляющий островами, Н.А. Гребницкий. Двухэтажный дом «строился» из канадской сосны и сохранил облик двух фасадов, а также часть подлинной обналички окон. Аналогов подобной застройки в России нет.
В последующие 25 лет в бухте Командор проходили археологические экспедиции. Были подняты со дна моря пушки пакетбота «Св. Пётр», найдено захоронение 6 человек, включая останки Витуса Беринга, подлинные кузница и наковальня.
К 250-летию открытия Командорских островов в 1991 музей перестроил свои внутренние помещения и открыл новые экспозиции и диорамы, представил предметы, найденные во время раскопок. Сделал реконструкция внешности Беринга. Залы музея украшали 12 рельефных изображений первооткрывателей, исследователей, священнослужителей - людей, которые связаны с историей Командорских островов.
Отдельный раздел был посвящён культуре алеутов: непромокаемая одежда - камлейка из кишок сивуча, торбаса из меха морских зверей, алеутские лыжи, костяные предметы и утварь, изделия прикладного искусства из береговой травы – знаменитое алеутское «шёлковое плетение», фигурки зверей и птиц, вырезанные косторезами из костей морской коровы и многое другое.
К 280-летию открытия островов в музее, пострадавшем от землетрясения, был сделан еще один ремонт. В настоящее время помимо экспозиции, посвященной экспедициям Беринга и реконструкции его внешности, вниманию посетителей представлены материалы по заселению островов от первых казачьих артелей XVIII в. и образования Российско-Американской Компании до аренды пушного промысла американской компанией "Гутчинсон, Коль и Со" в конце XIX в. Этнографический отдел повествует о традиционном природопользовании алеутов и взаимопроникновении культур. Также представлены материалы неолитической стоянки и геологического прошлого архипелага. Рассматриваются причины формирования и вымирания таких видов, как Стеллерова корова и Стеллеров баклан. Второй этаж демонстрирует временные экспозиции и исторические вехи ХХ века
Командорские острова необычайно притягательны для туристов всего мира. Круизные лайнеры с иностранцами стали привычны на рейде Никольского. Для удобства посетителей в музее все надписи сделаны на трёх языках: русском, английском, алеутском.